Alphacoronavirus -Alphacoronavirus

Alphacoronavirus
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Genom und Virionstruktur des porcinen epidemischen Durchfallvirus
Virusklassifizierung e
(ohne Rang): Virus
Bereich : Riboviria
Königreich: Orthornaviren
Stamm: Pisuviricota
Klasse: Pisoniviricetes
Befehl: Nidovirale
Familie: Coronaviridae
Unterfamilie: Orthocoronavirinae
Gattung: Alphacoronavirus
Untergattungen und Arten

Siehe Text

Alphacoronaviren (Alpha-CoV) gehören zur ersten der vier Gattungen ( Alpha- , Beta- , Gamma- und Delta- ) der Coronaviren . Sie sind einzelsträngige RNA-Viren mit positivem Sinn , die Säugetiere , einschließlich Menschen , infizieren . Sie haben kugelförmige Virionen mit keulenförmigen Oberflächenvorsprüngen, die durch Trimere des Spike-Proteins gebildet werden , und eine Virushülle .

Alphacoronaviren gehören zur Unterfamilie Orthocoronavirinae der Familie Coronaviridae . Sowohl die Alpha- als auch die Betacoronavirus- Linie stammen vom Genpool des Fledermausvirus ab . Alphacoronaviren waren früher als „ Coronaviren der Phylogruppe 1“ bekannt.

Etymologie

Der Name Alphacoronavirus leitet sich aus dem Altgriechischen ἄλφα ( álpha , „der erste Buchstabe des griechischen Alphabets “) und κορώνη (korṓnē, „Girlande, Kranz“) ab, was Krone bedeutet, was das Aussehen der Oberflächenprojektionen beschreibt, die unter dem Elektronenmikroskop zu sehen sind die einer Sonnenkorona ähneln .

Struktur

Das Virion ist umhüllt und kugelförmig mit einem Durchmesser von 120–160 nm und einer Kernschale von etwa 65 nm. Glykoproteine ​​und Trimere bilden große Oberflächenvorsprünge, die das Aussehen einer Sonnenkorona erzeugen. Diese Gattung besitzt wie andere Coronaviren ein Spike-Protein mit einer Typ-I-Fusionsmaschine (S2) und einer Rezeptor-bindenden Domäne (S1). Es fügt sich zu einem Trimer zusammen. Im Gegensatz zu Beta- und Gammacoronaviren wird dieses Protein nicht in zwei Hälften gespalten.

Genom

Genetische Beziehungen zwischen den verschiedenen Genotypen von Katzen-Coronaviren (FCov) und Hunde-Coronaviren (CCoV). Rekombination an Pfeilen.

Das Genom ist einzelsträngige RNA mit positiver Richtung mit einer Länge von 27 bis 29 Kilobasen und einem 3'-polyA-Schwanz. Zwei große, überlappende ORFs am 5'-Ende des Genoms codieren die wichtigsten nicht-strukturellen Proteine, die als Fusionsprotein durch ribosomalen Leserastersprung exprimiert werden . Diese umfassen Regionen mit Protease- , Helikase- und RNA-Polymerase-Motiven. Es gibt sieben weitere Gene stromabwärts, die Strukturproteine ​​kodieren. Diese werden von einem 3'-coterminalen verschachtelten Satz von subgenomischen mRNAs exprimiert .

Rekombination

Beide Typen des Alphacoronavirus 1 , das feline Coronavirus (FCoV) und das canine Coronavirus (CCoV), kommen in zwei Serotypen vor. Serotyp II zielt auf Aminopeptidase N ab , während der Rezeptor für Serotyp I unbekannt ist. Der Unterschied ist auf ein anderes Spike-Protein zurückzuführen. Es gibt einen gemeinsamen Vorfahren für FCoV und CCoV. Dieser Vorfahre entwickelte sich allmählich zu FCoV I und CCoV I. Ein S-Protein eines unbekannten Virus wurde in den Vorfahren rekombiniert und führte zu CCoV II. CCoV II wurde erneut mit FCoV kombiniert, um FCoV II zu schaffen. CCoV II entwickelte sich allmählich zu TGEV. Eine Spike-Deletion in TGEV erzeugt PRCV. Alle diese Viren werden in die Untergattung Tegacovirus eingeordnet .

Einstufung

Stammbaum der Gattung Alphacoronaviren mit rechts eingezeichneten Wirtstieren.

Folgende Untergattungen und Arten werden anerkannt:

Siehe auch

Verweise

Externe Links