eEF-1 - eEF-1

Elongation Faktor 1 Beta zentrale saure Region, Eukaryonten
Bezeichner
Symbol EF1_beta_säure
Pfam PF10587
InterPro IPR018940
CLEVER SM01182
Translationselongationsfaktor EF1B, Beta/Delta-Untereinheit, Guaninnukleotid-Austauschdomäne
Bezeichner
Symbol EF1_GNE
Pfam PF00736
InterPro IPR014038
CLEVER SM00888
CDD cd00292

eEF-1 sind zwei eukaryotische Elongationsfaktoren . Es bildet zwei Komplexe, das EF-Tu- Homolog EF-1A und das EF-Ts- Homolog EF-1B , den Guanid-Austauschfaktor des ersteren. Beide kommen auch in Archaeen vor .

Struktur

Die Nomenklatur für die eEF-1-Untereinheiten hat sich um ca. 2001 etwas verschoben, da erkannt wurde, dass die EF-1A- und EF-1B-Komplexe in gewissem Maße unabhängig voneinander sind. Zu den derzeit anerkannten und benannten Komponenten gehören:

Aktuelle Nomenklatur Alte Nomenklatur Menschliche Gene Kanonische Funktion
eEF1A eEF1α EEF1A1 , EEF1A2
EEF1A1P43 		aa-tRNA-Abgabe an das Ribosom; assoziiert mit aa-tRNA-Synthase-Komplex.
eEF1Bα eEF1β (Tier, Pilze)
eEF1β' (Pflanze) 		EEF1B2
EEF1B2P1 , EEF1B2P2 , EEF1B2P3 		GEF für eEF1A.
eEF1Bβ eEF1β (Pflanze) (Keiner) Zusätzlicher GEF für eEF1A in Pflanzen mit CDF-Kinase-kontrollierter Aktivität.
eEF1Bγ eEF1γ EEF1G Strukturelle Komponente.
eEF1Bδ eEF1δ EEF1D Zusätzliche GEF für eEF1A bei Tieren.
eEF1ε eEF1ε EEF1E1 Nicht wirklich ein Dehnungsfaktor. Gerüst für den aa-tRNA-Synthase-Komplex.
Val-RS Val-RS VARS Valyl-tRNA-Synthetase, bindet eEF1Bδ bei Kaninchen.

Die genaue Art und Weise, wie die eEF1B-Untereinheit an eEF1A bindet, variiert je nach Organ und Spezies. eEF1A bindet auch Aktin .

Andere Arten

Verschiedene Arten von Grünalgen , Rotalgen , Chromalveolaten und Pilzen haben kein EF-1α-Gen, sondern besitzen stattdessen ein verwandtes Gen namens EFL (Elongation Factor-like). Obwohl seine Funktion nicht eingehend untersucht wurde, scheint es EF-1α ähnlich zu sein.

Seit 2009 sind nur zwei Organismen bekannt, die sowohl EF-1α als auch EFL aufweisen: der Pilz Basidiobolus und die Kieselalge Thalassiosira . Die Evolutionsgeschichte von EFL ist unklar. Es kann ein oder mehrere Male aufgetreten sein, gefolgt von einem Verlust von EFL oder EF-1α. Das Vorkommen in drei verschiedenen eukaryotischen Gruppen (Pilze, Chromalveolate und Archaeplastida ) soll laut einer Überprüfung aus dem Jahr 2009 das Ergebnis von zwei oder mehr horizontalen Gentransferereignissen sein . Ein Bericht aus dem Jahr 2013 findet 11 weitere Arten mit beiden Genen und lieferte eine alternative Hypothese, dass ein Vorfahreneukaryot beide Gene haben könnte. In allen bekannten Organismen, in denen beide Gene vorhanden sind, neigt EF-1α dazu, transkriptionell reprimiert zu werden. Wenn die Hypothese zutrifft, würden Wissenschaftler erwarten, einen Organismus zu finden, der einen unterdrückten EFL und einen voll funktionsfähigen EF-1α hat.

Eine Überprüfung von EF-1α/EFL aus dem Jahr 2014, die Eukaryoten besitzen, hält beide Erklärungen allein für unzureichend, um die komplexe Verteilung dieser beiden Proteine ​​in Eukaryoten zu erklären.

Bei Eukaryoten ist eine verwandte GTPase namens eRF3 an der Translationstermination beteiligt. Das archaeale EF-1α hingegen übernimmt alle Funktionen dieser subfunktionalisierten Varianten.

Siehe auch

Verweise

Externe Links