GISAID - GISAID

GISAID-Initiative
Offizielles GISAID-Logo
Abkürzung GISAID
Formation Mai 2008 ; vor 13 Jahren ( Mai 2008 )
Typ Gemeinnützige Organisation
Öffentlich-private Partnerschaft
Zweck Globale Gesundheit , Forschung , Bildung
Hauptquartier München , Deutschland
Bereich bedient
Weltweit
Methode Spenden und Zuschüsse
Schlüsselpersonen
Webseite gisaid.org

GISAID ist eine globale Wissenschaftsinitiative und primäre Quelle, die 2008 gegründet wurde und einen offenen Zugang zu genomischen Daten von Influenzaviren und dem für die COVID-19- Pandemie verantwortlichen Coronavirus bietet . Am 10. Januar 2020 wurden die ersten Ganzgenomsequenzen von SARS-CoV-2 auf GISAID zur Verfügung gestellt, die globale Reaktionen auf die Pandemie ermöglichten, einschließlich der Entwicklung erster Impfstoffe und diagnostischer Tests zum Nachweis von SARS-CoV-2. GISAID erleichtert die genomische Epidemiologie und Echtzeitüberwachung, um das Auftreten neuer COVID-19-Virusstämme auf der ganzen Welt zu überwachen.

Seit seiner Einführung als Alternative zum Austausch von Vogelgrippedaten über herkömmliche öffentlich zugängliche Archive wurde GISAID dafür anerkannt, dass es Anreize für einen schnellen Austausch von Ausbruchsdaten während der H1N1- Pandemie im Jahr 2009, der H7N9- Epidemie im Jahr 2013 und der COVID-19- Pandemie im Jahr 2020 geschaffen hat .

GISAID wurde 2017 von den G20- Gesundheitsministern für seine Bedeutung für die globale Gesundheit gewürdigt , und 2020 nannte der Chefwissenschaftler der Weltgesundheitsorganisation die datenwissenschaftliche Initiative „einen Game Changer“.

Herkunft

Das Akronym GISAID gefunden erste Erwähnung in einer Korrespondenz Brief veröffentlicht in der Zeitschrift Nature im Jahr 2006 setzen vorwärts eine anfängliche Ansaugen von einer „Schaffung Konsortium “ für eine neue G lobale I nitiative auf S haring A vian I nfluenza D ata, wobei seine Mitglieder würden Veröffentlichung von Daten in öffentlich zugänglichen Datenbanken bis zu sechs Monate nach Analyse und Validierung.

Eine Gruppe von Wissenschaftlern posiert bei einem Treffen im Freien
GISAID Next Generation Sequencing Workshop ( Institut Pasteur , Paris 2015)

Obwohl keine wesentlichen Grundregeln für die gemeinsame Nutzung eingerichtet wurden, wurde die Korrespondenz Brief von mehr als 70 führenden Wissenschaftlern unterzeichnet, darunter sieben Nobelpreisträger , weil der Zugang zu den aktuellsten genetischen Daten für den hochpathogene H5N1 zoonotischen Virus oft wurde teilweise eingeschränkt, auf dem durch Zögern der Mitgliedstaaten der Weltgesundheitsorganisation , ihre Virusgenome zu teilen und Eigentumsrechte zu gefährden.

Es würde weitere 18 Monate dauern, bis ein internationaler Konsens über die tatsächlichen Regeln des GISAID-Sharing-Mechanismus zwischen Regierungen und Forschern erreicht werden könnte. So wurde GISAID im Mai 2008 in Genf anlässlich der 61. Weltgesundheitsversammlung offiziell als öffentlich zugängliche Datenbank und nicht als mitgliedschaftspflichtiges Konsortium ins Leben gerufen.

Sich nähern

Als Modell für zukünftige Initiativen wurde das GISAID-Modell empfohlen, Anreize zu schaffen und diejenigen anzuerkennen, die Daten hinterlegen. Größere Transparenz und ein zeitnaherer Austausch von Sequenzdaten ist ein Ziel vieler Forscher und Interessengruppen gleichermaßen. Die GISAID-Plattform überspannt nationale Grenzen und wissenschaftliche Disziplinen mit führenden Köpfen in den Bereichen Veterinärmedizin , Humanmedizin , Bioinformatik , Epidemiologie und geistiges Eigentum . Diese interdisziplinäre Anstrengung bietet neue Möglichkeiten zur Kommunikation und zum Austausch von Informationen, da jede Disziplin unterschiedliche Interessen hat, aber auch ähnliche Ziele verfolgt. Die Initiative sei in einer Weise zusammengekommen, die den Dateneinreichern Anerkennung zolle und erhebliche Anstrengungen unternehme, mit ihnen zu arbeiten und sie in kollaborative Analysen zu viralen Sequenzdaten einzubeziehen, "um die Waage für die Zusammenarbeit weiter zu kippen". Die Idee, nicht nur Daten, sondern auch die Vorteile der daraus resultierenden Forschung zu teilen, stellte einen "Paradigmenwechsel" dar, der Mitwirkende aus höheren und niedrigeren Ressourcenumgebungen gleichberechtigter stellt.

Geschichte

Peter Bogner schüttelt Robert Kloos die Hand
Offizielle Unterzeichnungszeremonie mit GISAID-Präsident Peter Bogner (l) und Bundesstaatssekretär Robert Kloos Quelle: BMELV ( Berlin , April 2010)

Die GISAID-Initiative wurde ursprünglich von Peter Bogner – einem strategischen Berater und Leiter des internationalen Rundfunks – finanziert, der als Gründer und Hauptvermittler fungiert. Bogner hat den Aufbau dieser Plattform geleitet, indem es die weltweit führenden Wissenschaftler und Interessengruppen zusammenbringt, die sich aktiv dafür einsetzen, das Verständnis dieser potenziellen menschlichen Pandemie durch den schnellen Austausch wissenschaftlicher Daten und Ergebnisse zu beschleunigen. Im Januar 2006 traf sich Bogner mit dem US-Heimatschutzminister Michael Chertoff beim Weltwirtschaftsforum in Davos , Schweiz , und informierte sich über das Bereitschaftskonzept der US-Regierung zum Umgang mit dem Potenzial einer Grippepandemie. Die Besorgnis über ein Pandemie-Szenario nahm zu.

Im November 2006 erhielt die Initiative die Zustimmung sowohl der Royal Society als auch der Academy of Medical Sciences . Im Februar 2007 wurde bekannt gegeben, dass GISAID und das Schweizerische Institut für Bioinformatik , das ein Schweizer Konsortium zur Verwaltung der GISAID-Datenbank zu Influenza-Virusstämmen leitet, eine Kooperationsvereinbarung unterzeichnet haben. Im Rahmen dieser Vereinbarung sollte das Genfer Institut Dienstleistungen für die sichere Speicherung und Analyse genetischer, epidemiologischer und klinischer Daten erbringen.

Im Januar 2007 hat Indonesien die Weitergabe aller klinischen H5N1-Proben an die WHO eingestellt. Im März 2007 gab der indonesische Gesundheitsminister Siti Fadilah Supari bekannt, dass die indonesische Regierung die Bildung der Global Initiative on Sharing Avian Influenza Database (GISAID) nach einem hochrangigen WHO-Treffen in Jakarta über verantwortungsvolle Praktiken für den Austausch von Vogelgrippeviren unterstützt. Im April 2007 bekräftigte die Indonesische Akademie der Wissenschaften ihre Zustimmung zu GISAID und erklärte, dass sie dieselben Ideale bezüglich des freien Austauschs und der verantwortungsvollen Weitergabe von Informationen über die Vogelgrippe und neu auftretende Infektionskrankheiten vertritt.

Im Jahr 2008 wurde GISAID von den „WHO Collaborating Centers for Influenza“ für die Eingabe von Sequenzdaten aus Proben, die von National Influenza Centers (NICs) erhalten wurden, in das Global Influenza Surveillance and Response System der WHO übernommen .

Im April 2010 gab die Bundesrepublik Deutschland während der 7. Internationalen Ministerkonferenz zur Vogelgrippe und Influenzapandemie in Hanoi , Vietnam, bekannt , dass die GISAID-Initiative eine Kooperationsvereinbarung mit der Bundesregierung eingegangen ist, die Deutschland zum langfristigen Gastgeber der GISAID . macht Plattform. Im Rahmen der Vereinbarung wird Deutschland, vertreten durch das Bundesministerium für Ernährung, Landwirtschaft und Verbraucherschutz BMELV , die Nachhaltigkeit der Initiative sicherstellen, indem es über seine Bundesanstalt für Landwirtschaft und Ernährung (BLE) die technischen Hosting-Einrichtungen der GISAID-Plattform und EpiFlu . bereitstellt ™-Datenbank mit Sitz in Bonn . Das Bundesinstitut für Tiergesundheit, das Friedrich-Loeffler-Institut (FLI) auf der Insel Riems , wird die Plausibilität und Kuratierung der wissenschaftlichen Daten in GISAID nach wissenschaftlichen Standards sicherstellen.

Am 10. Januar 2020 wurden die ersten SARS-CoV-2-Gensequenzen vom Chinesischen Zentrum für die Kontrolle und Prävention von Krankheiten freigegeben und über GISAID geteilt. Im Laufe des Jahres 2020 wurden riesige Mengen an SARS-CoV-2-Genomsequenzen, die weltweit beprobt und analysiert wurden, der GISAID-Datenbank hinzugefügt und von Labors auf der ganzen Welt schnell geteilt.

SARS-CoV-2-Datenbank

Von der Freigabe der ersten vollständigen Genomsequenzen von SARS-CoV-2 Anfang Januar 2020 bis Mitte April 2021 erreichte die SARS-CoV-2-Datenbank von GISAID über 1.200.000 Einreichungen, ein Beweis für die harte Arbeit von Forschern in über 170 verschiedenen Ländern. Nur drei Monate später hatte sich die Zahl der hochgeladenen SARS-CoV-2-Sequenzen erneut auf über 2,4 Millionen verdoppelt. Während des ersten Jahres der COVID-19-Pandemie wurden die meisten der SARS-CoV-2-Gesamtgenomsequenzen, die generiert und weltweit geteilt wurden, über GISAID eingereicht.

Führung

Die Governance- Struktur von GISAID sieht mehrere unabhängig voneinander agierende Organisationsorgane vor, um Voreingenommenheit bei der Entscheidungsfindung zu vermeiden. Die Verwaltungsangelegenheiten von GISAID werden von einem Kuratorium überwacht, von dem erwartet wird, dass es potenzielle Interessenkonflikte in Bezug auf die Finanzierungsquellen von GISAID minimiert. Die wissenschaftliche Aufsicht über die Initiative kommt von ihrem wissenschaftlichen Beirat, der sich aus Direktoren führender Labors der öffentlichen Gesundheit, darunter alle sechs WHO-Kooperationszentren für Influenza, und Direktoren von Referenzlabors für Tiergesundheit für die Erforschung der Vogelgrippe für die Weltorganisation für Tiergesundheit und die Ernährungs- und Landwirtschaftsorganisation der Vereinten Nationen . Diese Führungsstruktur soll die Funktionsfähigkeit der EpiFlu ™ Datenbank von GISAID der Datenbank des Technischen Gruppe, bestehend aus Experten in verwaltetem verbessern Virus - Sequenzierung und Bioinformatik , die stellen die User - Community zu interagieren mit Software und Entwickler von Tools für die Analyse.

Zugang und geistiges Eigentum

Im Gegensatz zu gemeinfreien Datenbanken wie GenBank und EMBL müssen die Benutzer von GISAID ihre Identität bestätigen lassen und einer Vereinbarung zum Datenbankzugriff zustimmen, die die Art und Weise regelt, wie GISAID-Daten verwendet werden können. Diese Nutzungsbedingungen verhindern, dass Benutzer Daten mit anderen Benutzern teilen, die den Nutzungsbedingungen nicht zugestimmt haben. Die Nutzungsbedingungen verlangen, dass Benutzer der Daten die Datengeneratoren in veröffentlichten Arbeiten anerkennen und auch einen angemessenen Versuch unternehmen, mit Datengeneratoren zusammenzuarbeiten und sie in Forschungen und Analysen einzubeziehen, die ihre Daten verwenden.

Eine Schwierigkeit, die das Datenzugangsabkommen von GISAID anzugehen versucht, besteht darin, dass viele Forscher befürchten, dass die Weitergabe von Influenza-Sequenzdaten deren widerrechtliche Aneignung durch Ansprüche auf geistiges Eigentum durch die Impfstoffindustrie und andere erleichtern könnte, was den Zugang zu Impfstoffen und anderen Artikeln in Entwicklungsländern entweder durch hohe Kosten erschwert oder durch Verhinderung des Technologietransfers . Während die meisten Experten von öffentlichem Interesse GISAID zustimmen, dass Influenza-Sequenzdaten veröffentlicht werden sollten, und dies ist Gegenstand der Zustimmung vieler Forscher, stellen einige die Informationen erst nach Einreichung von Patentansprüchen zur Verfügung, während andere gesagt haben, dass der Zugriff darauf nur auf dem Bedingung, dass keine Patente oder andere Ansprüche auf geistiges Eigentum angemeldet werden. Die Datenzugriffsvereinbarung von GISAID spricht dies direkt an, um den Austausch von Daten zu fördern. Die Verfahren von GISAID legen zudem nahe, dass diejenigen, die auf die EpiFlu-Datenbank zugreifen, die Herkunftsländer der genetischen Sequenzen und die Forscher, die die Sequenzen entdeckt haben, konsultieren. Infolgedessen hat die GISAID-Lizenz den Bereich der viralen Sequenzdatenanalyse verändert.

Verweise

Weiterlesen

Externe Links