Guanosin-Nucleotid-Dissoziationsinhibitor - Guanosine nucleotide dissociation inhibitor
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 Struktur des doppelt prenylierten ypt1: gdi-Komplexes
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| Kennungen | |||||||||||
| Symbol | GDI | ||||||||||
| Pfam | PF00996 | ||||||||||
| Pfam- Clan | CL0063 | ||||||||||
| InterPro | IPR018203 | ||||||||||
| SCOP2 | 1gnd / SCOPe / SUPFAM | ||||||||||
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In der Molekularbiologie bilden die Guanosin-Dissoziationsinhibitoren ( GDI ) eine Familie kleiner GTPasen , die eine regulatorische Rolle im vesikulären Membranverkehr spielen. GDIs binden an die GDP-gebundene Form von Rho und Rab kleinen GTPasen und verhindern nicht nur den Austausch (Halten der kleinen GTPase in einem ausgeschalteten Zustand), sondern auch die Lokalisierung der kleinen GTPase an der Membran, die ihr Wirkort ist. Diese Hemmung kann durch die Wirkung eines GDI-Verschiebungsfaktors aufgehoben werden. GDIs hemmen cdc42 auch, indem sie an seinen Schwanz binden und seine Insertion in Membranen verhindern; Daher kann es keine WASPs auslösen und nicht zur Keimbildung von F- Actin führen .
Die C-terminale Geranylgeranylierung der GDIs ist entscheidend für ihre Membranassoziation und -funktion. Diese posttranslationale Modifikation wird durch Rab-Geranylgeranyltransferase (Rab-GGTase) katalysiert, ein Enzym mit mehreren Untereinheiten , das ein katalytisches Heterodimer und eine akzessorische Komponente enthält, die als Rab-Escort-Protein (REP) -1 bezeichnet wird. REP-1 präsentiert der katalytischen Komponente neu synthetisierte Rab- Proteine und bildet nach der Transferreaktion einen stabilen Komplex mit den prenylierten Proteinen . Der Mechanismus der REP-1-vermittelten Membranassoziation von Rab5 ähnelt dem, der durch den Rab GDP Dissoziationsinhibitor (GDI) vermittelt wird. REP-1 und Rab GDI teilen auch andere funktionelle Eigenschaften, einschließlich der Fähigkeit, die Freisetzung von GDP zu hemmen und Rab-Proteine aus Membranen zu entfernen.
Die Kristallstruktur der Rinder- Alpha- Isoform von Rab GDI wurde mit einer Auflösung von 1,81 Angström bestimmt . Das Protein besteht aus zwei Hauptstruktureinheiten: eine großen , komplexen mehrblättrigen Domäne I und eine kleineren alpha-helikale Domäne II.
Die strukturelle Organisation der Domäne I ist eng mit FAD- haltigen Monooxygenasen und Oxidasen verwandt . Konservierte Regionen, die GDI gemeinsam sind, und das Choroiderämie- Genprodukt , das Rab an katalytische Untereinheiten der Rab- Geranylgeranyltransferase II liefert , sind auf einer Seite der Domäne geclustert. Die beiden am besten konservierten Regionen bilden am Scheitelpunkt des Moleküls eine kompakte Struktur . Die ortsgerichtete Mutagenese hat gezeigt, dass diese Regionen eine entscheidende Rolle bei der Bindung von Rab-Proteinen spielen.
Verweise
Externe Links
- Guanin + Nucleotid + Dissoziation + Inhibitoren bei der US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)