Humanes Coronavirus HKU1 -Human coronavirus HKU1

Humanes Coronavirus HKU1
Coronavirus-HKU1.png
Bildung von HcoV-HKU1.
Virusklassifizierung e
(ohne Rang): Virus
Bereich : Riboviria
Königreich: Orthornaviren
Stamm: Pisuviricota
Klasse: Pisoniviricetes
Befehl: Nidovirale
Familie: Coronaviridae
Gattung: Betacoronavirus
Untergattung: Embecovirus
Spezies:
Humanes Coronavirus HKU1

Das humane Coronavirus HKU1 ( HCoV-HKU1 ) ist eine Art des Coronavirus beim Menschen. Sie verursacht eine Erkrankung der oberen Atemwege mit Erkältungssymptomen , kann aber zu Lungenentzündung und Bronchiolitis führen . Es wurde erstmals im Januar 2004 von einem Mann in Hongkong entdeckt . Nachfolgende Forschungen ergaben, dass es eine globale Verbreitung und eine frühere Genese hat.

Das Virus ist ein umhülltes , einzelsträngiges RNA-Virus mit positivem Sinn , das in seine Wirtszelle eindringt, indem es an den N-Acetyl-9-O-Acetylneuraminsäure-Rezeptor bindet . Es hat das Hämagglutinin-Esterase (HE)-Gen, das es als Mitglied der Gattung Betacoronavirus und Untergattung Embecovirus unterscheidet .

Geschichte

HCoV-HKU1 wurde erstmals im Januar 2004 bei einem 71-jährigen Mann nachgewiesen, der aufgrund eines akuten Atemnotsyndroms und einer röntgenologisch bestätigten beidseitigen Lungenentzündung ins Krankenhaus eingeliefert wurde . Der Mann war kürzlich aus Shenzhen, China, nach Hongkong zurückgekehrt .

Virologie

Woo und Mitarbeiter waren bei ihren Versuchen, ein HCoV-HKU1-Isolat zu züchten, erfolglos, konnten aber die vollständige Genomsequenz erhalten. Die phylogenetische Analyse zeigte, dass HKU1 am engsten mit dem Maus-Hepatitisvirus (MHV) verwandt ist und sich in dieser Hinsicht von anderen bekannten humanen Betacoronaviren wie HCoV-OC43 unterscheidet .

Bei der Analyse der RNA-abhängigen RNA-Polymerase (RdRp), Spike (S) und Nukleokapsid (N)-Gene wurden inkompatible phylogenetische Beziehungen entdeckt. Die vollständige Genomsequenzierung von 22 HCoV-HKU1-Stämmen bestätigte, dass dies auf die natürliche Rekombination zurückzuführen ist. HCoV-HKU1 stammt wahrscheinlich von Nagetieren .

HCoV-HKU1 ist eines von sieben bekannten Coronaviren, die den Menschen infizieren. Die anderen sechs sind:

Die Strukturen der HCoV-HKU1-Spike (S)- und HE-Proteine ​​wurden 2016 bzw. 2020 durch Cryo-EM aufgeklärt . Das S-Protein ( PDB : 5I08 ​) ist für seine große Größe bekannt. Das HE-Protein ( PDB : 6Y3Y ​) unterscheidet sich von herkömmlichen (wie dem in OC43) durch eine viel kleinere Rest-Lectin-Domäne. Diese Domäne wird durch Größenänderungen und Glykosylierung vor der Erkennung durch das Immunsystem geschützt.

Epidemiologie

Eine Rückverfolgungsanalyse von SARS-negativen nasopharyngealen Aspiraten von Patienten mit Atemwegserkrankungen während der SARS-Periode im Jahr 2003 identifizierte das Vorhandensein von CoV-HKU1-RNA in der Probe einer 35-jährigen Frau mit Lungenentzündung.

Nach den ersten Berichten über die Entdeckung von HCoV-HKU1 wurde das Virus im selben Jahr bei 10 Patienten in Nordaustralien identifiziert . Atemproben wurden zwischen Mai und August (Winter in Australien) gesammelt. Die Ermittler fanden heraus, dass die meisten HCoV-HKU1-positiven Proben von Kindern in den späteren Wintermonaten stammten.

Die ersten bekannten Fälle in der westlichen Hemisphäre wurden 2005 entdeckt, nachdem klinische Virologen des Yale-New Haven Hospital in New Haven, Connecticut , ältere Proben analysiert hatten , die neugierig waren, ob HCoV-HKU1 in ihrer Gegend vorkommt. Sie führten eine Studie mit Proben durch, die in einem Zeitraum von 7 Wochen (Dezember 2001 – Februar 2002) bei 851 Säuglingen und Kindern gesammelt wurden. Exemplare von neun Kindern hatten das humane Coronavirus HKU1. Diese Kinder hatten zum Zeitpunkt der Probenentnahme Atemwegsinfektionen (bei einem Mädchen so schwer, dass eine mechanische Beatmung erforderlich war), während sie auf andere Ursachen wie das Humane Respiratorische Syncytialvirus (RSV), Parainfluenzaviren (Typen 1–3) negativ getestet wurden. Influenza A- und B-Viren und Adenovirus durch direkten Immunfluoreszenzassay sowie humanes Metapneumovirus und HCoV-NH durch reverse Transkriptions-Polymerase-Kettenreaktion (RT-PCR). Die Forscher berichteten, dass die in New Haven identifizierten Stämme denen in Hongkong ähnlich waren und eine weltweite Verbreitung nahelegten. Diese in New Haven gefundenen Stämme sind nicht mit HCoV-NH (New Haven Coronavirus) zu verwechseln , bei dem es sich um einen Stamm des menschlichen Coronavirus NL63 handelt .

Im Juli 2005 wurden in Frankreich sechs Fälle gemeldet. In diesen Fällen verwendeten französische Forscher verbesserte Techniken zur Gewinnung des Virus aus Nasen-Rachen-Aspiraten und Stuhlproben.

Siehe auch

Verweise

Externe Links