Internationales Human Epigenome Consortium - International Human Epigenome Consortium
Das International Human Epigenome Consortium (IHEC) ist eine 2010 gegründete wissenschaftliche Organisation, die dazu beiträgt, die globalen Bemühungen auf dem Gebiet der Epigenomik zu koordinieren . Das ursprüngliche Ziel bestand darin, mindestens 1.000 Referenz- Epigenome (Basislinien) aus verschiedenen Arten normaler und krankheitsbedingter menschlicher Zelltypen zu generieren .
Struktur und Finanzierung
Die Operationen der IHEC werden von ihren Vollmitgliedern (nationalen und regionalen wissenschaftlichen Finanzierungsagenturen) finanziert und größtenteils auf freiwilliger Basis von Wissenschaftlern und anderen Experten aus teilnehmenden Finanzierungsagenturen und Epigenom-Kartierungsprojekten besetzt.
Aktuelle IHEC-Mitgliedsländer
- Kanadische Institute für Gesundheitsforschung (Kanada)
- Europäische Kommission (EU)
- Bundesministerium für Bildung und Forschung , Projektmanagementagentur im Deutschen Zentrum für Luft- und Raumfahrt (Deutschland)
- Genome Institute of Singapore (Singapur)
- Hong Kong Epigenomics Project (Hongkong)
- Japanische Agentur für medizinische Forschung und Entwicklung (Japan)
- Nationales Institut für Gesundheit (Südkorea)
- National Institutes of Health : Roadmap Epigenomics Program und Encyclopedia of DNA Elements ( ENCODE ) -Projekt (USA)
Darüber hinaus sind Länder und Agenturen, die IHEC-Ziele unterstützen, Organisationen, die noch keinen vollständigen finanziellen Beitrag zum Projekt geleistet haben, deren Mitglieder jedoch Zeit und Fachwissen zur Verfügung stellen:
- Europäisches Institut für Onkologie , FIRC-Institut für Molekulare Onkologie, Italienisches Technologieinstitut , Zentrum für Genomwissenschaft (Italien)
- Nationale Forschungsagentur (Frankreich)
- Nationaler Rat für Gesundheit und medizinische Forschung (Australien)
- UK Funders Alliance: Medizinischer Forschungsrat , Forschungsrat für Biotechnologie und Biowissenschaften , Cancer Research UK und Wellcome Trust (UK)
Die Aufsicht über IHEC wird von einem Exekutivkomitee übernommen, dessen Mitglieder von Vollmitgliedsorganisationen ernannt werden. Dieses Komitee arbeitet eng mit einem Internationalen Wissenschaftlichen Lenkungsausschuss zusammen, dessen Mitglieder die wissenschaftlichen Leiter der teilnehmenden Projekte und andere Leiter auf dem Gebiet der Epigenetik sind, sowie mit einem Datenkoordinierungszentrum. Zusätzliches Fachwissen bringen Arbeitsgruppen ein, die sich aus Mitgliedern teilnehmender Forschungsprojekte zusammensetzen.
IHEC interagiert und koordiniert seine Bemühungen mit anderen großen internationalen Genomikprojekten wie dem International Cancer Genome Consortium (ICGC), ENCODE . Und der Global Alliance for Genomics and Health. Ausschuss- und Arbeitsgruppenmitglieder sowie andere an der IHEC beteiligte Personen treffen sich jährlich zu einer Veranstaltung, die von den Mitgliedsländern abwechselnd veranstaltet wird. Die meisten Treffen finden in Verbindung mit einem wissenschaftlichen Symposium statt, von dem einige für Nicht-IHEC-Wissenschaftler und manchmal auch für die Öffentlichkeit zugänglich sind.
Tore
Das ultimative Ziel von IHEC ist es zu bestimmen, wie das Epigenom die menschliche Bevölkerung über Generationen hinweg und als Reaktion auf die Umwelt geformt hat. Die erste Phase der IHEC-Aktivitäten umfasst die Koordinierung der Produktion von mindestens 1.000 Referenz-Epigenomen aus gesunden und erkrankten menschlichen Zellen sowie einer begrenzten Anzahl von Modellorganismen, die für bestimmte menschliche Krankheiten relevant sind. Der anfängliche Fokus liegt auf zellulären Zuständen wie Stammzellen, Unsterblichkeit, Proliferation , Differenzierung , Seneszenz und Stress. Das Referenz-Epigenom für jede Probe umfasst hochauflösende Karten der DNA-Methylierung und der wichtigsten regulatorischen Histonmodifikationen mit entsprechenden Informationen über Typ und Expressionsniveau aller transkribierten Gene ( Protein- kodierende sowie nicht-kodierende / kleine RNAs). Die erzeugten Daten werden der Forschungsgemeinschaft über das IHEC-Datenportal, das Europäische Genom-Phänom-Archiv (EGA) und andere Veranstaltungsorte frei zur Verfügung gestellt.
Darüber hinaus befassen sich teilnehmende Forschungsprojekte mit der Entwicklung neuer Epigenomics und der damit verbundenen Bioinformatik- Methoden.
Im November 2016 veröffentlichten IHEC-Mitglieder aus Kanada, dem BLUEPRINT-Konsortium der Europäischen Union, dem Deutschen Epigenom-Programm „DEEP“, Japan, Singapur und den USA eine Gruppe von 41 koordinierten Artikeln in Cell Press und anderen Fachzeitschriften. Die Arbeiten enthielten Beschreibungen der Molekularbiologie und der Berechnungsmethoden sowie neue Forschungsergebnisse zur Normal- und Krankheitsbiologie.
Siehe auch
Verweise