Tag-Suite für Zeitschriftenartikel - Journal Article Tag Suite

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Status Veröffentlicht
Erstmals veröffentlicht 31. März 2003 ( 2003-03-31 )
Letzte Version NISO JATS 1.2
8. Februar 2019 ( 2019-02-08 )
Organisation
Autoren
Basisstandards XML
Zugehörige Normen
Domain
Abkürzung JATS
Webseite jats .nlm .nih .gov

Die Journal Article Tag Suite ( JATS ) ist ein XML- Format, das verwendet wird, um online veröffentlichte wissenschaftliche Literatur zu beschreiben . Es handelt sich um einen technischen Standard, der von der National Information Standards Organization (NISO) entwickelt und vom American National Standards Institute mit dem Code Z39.96-2012 genehmigt wurde .

Das NISO-Projekt war eine Fortsetzung der Arbeit von NLM/NCBI und wurde von PubMed Central des NLM als De-facto- Standard für die Archivierung und den Austausch wissenschaftlicher Open-Access-Zeitschriften und ihrer Inhalte mit XML populär gemacht .

Mit der NISO-Standardisierung hat die NLM-Initiative eine größere Reichweite gewonnen, und mehrere andere Repositorien, wie SciELO und Redalyc , haben die XML-Formatierung für wissenschaftliche Artikel übernommen .

Das JATS bietet eine Reihe von XML-Elementen und -Attributen zur Beschreibung des textlichen und grafischen Inhalts von Zeitschriftenartikeln sowie einigem Material, das kein Artikel ist, wie Briefe, Leitartikel und Buch- und Produktrezensionen. JATS ermöglicht Beschreibungen des gesamten Artikelinhalts oder nur die Metadaten der Artikelkopfzeile; und erlaubt andere Arten von Inhalten, einschließlich Forschungs- und Nicht-Forschungsartikeln, Briefen, Leitartikeln sowie Buch- und Produktrezensionen.

Geschichte

Seit seiner Einführung hat sich die NLM Archiving and Interchange DTD- Suite von NCBI zum De-facto- Standard für das Markup von Zeitschriftenartikeln im wissenschaftlichen Publizieren entwickelt . Mit der Einführung von NISO JATS wurde es zu einem echten Standard erhoben . Auch ohne öffentlichen Datenaustausch bietet die Einführung von NISO JATS den Verlagen Vorteile in Bezug auf die Optimierung der Produktionsabläufe und die Optimierung der Systeminteroperabilität.

Zeitleiste

NLM JATS
NLM JATS, Version 1
  • 31. März 2003 : Einführung von NLM DTD v1.0. ( 2003-03-31 )
  • 5. November 2003 : Version 1.1-Update veröffentlicht. ( 2003-11-05 )
NLM JATS, Version 2
  • 30. Dezember 2004 : Version 2.0 Hauptupdate veröffentlicht. Es wurde entwickelt, um Best Practices für die Anpassung zu unterstützen. ( 2004-12-30 )
  • 14. November 2005 : Version 2.1 Update veröffentlicht mit dem Zusatz der Article Authoring DTD . ( 2005-11-14 )
  • 8. Juni 2006 : Version 2.2-Update veröffentlicht. ( 2006-06-08 )
  • 28. März 2007 : Version 2.3-Update veröffentlicht. ( 2007-03-28 )
NLM JATS, Version 3
  • 21. November 2008 : Version 3.0 Hauptupdate veröffentlicht. ( 2008-11-21 )
NISO JATS
NISO JATS, Version 1.0
  • 30. März 2011  – 30. September 2011 : Erster Entwurf, NISO Z39.96.201x Version 0.4 veröffentlicht; sechsmonatige Stellungnahmefrist. ( 2011-03-30 ) ( 2011-09-30 )
  • 15. Juli 2012 : NISO JATS, v1.0 hat die NISO-Zulassung erhalten. ( 2012-07-15 )
  • 9. August 2012 : NISO JATS, v1.0 hat die ANSI-Zulassung erhalten. ( 2012-08-09 )
  • 22. August 2012 : ANSI/NISO Z39.96-2012, JATS: Journal Article Tag Suite (Version 1.0) veröffentlicht. Es unterstützt vollständige Abwärtskompatibilität mit NLM JATS v3.0. ( 2012-08-22 )
NISO JATS, Version 1.1
  • 9. Dezember 2013 : Erster Entwurf, NISO JATS, v1.1d1 veröffentlicht. ( 2013-12-09 )
  • 29. Dezember 2014 : Zweiter Entwurf, NISO JATS, v1.1d2 veröffentlicht. ( 2014-12-29 )
  • 14. April 2015 : Dritter Entwurf, NISO JATS, v1.1d veröffentlicht. ( 2015-04-14 )
  • 22. Oktober 2015 : NISO JATS, v1.1 hat die NISO-Zulassung erhalten. ( 2015-10-22 )
  • 19. November 2015 : NISO JATS, v1.1 erhält ANSI-Zulassung ( 2015-11-19 )
  • 6. Januar 2016 : ANSI/NISO Z39.96-2015, JATS: Journal Article Tag Suite, Version 1.1 veröffentlicht. ( 2016-01-06 )
NISO JATS, Version 1.2
  • 20. Juli 2017 : Erster Entwurf, NISO JATS, v1.2d1 veröffentlicht. ( 2017-07-20 )
  • 23. Mai 2018 : Erster Entwurf, NISO JATS, v1.2d2 veröffentlicht. ( 2018-05-23 )
  • 8. Februar 2019 : ANSI/NISO Z39.96-2019, JATS: Journal Article Tag Suite, Version 1.2 veröffentlicht. ( 2019-02-08 )
NISO JATS, Version 1.3
  • 7. Juli 2021 : ANSI/NISO Z39.96-2021, JATS: Journal Article Tag Suite, Version 1.3 veröffentlicht. ( 2021-07-07 )

Technischer Umfang

Dies ist konstruktionsbedingt ein Modell für Zeitschriftenartikel, wie z. B. der typische Forschungsartikel in einer STM-Zeitschrift , und kein Modell für vollständige Zeitschriften.

Tag-Sets

Die 3 Spezifikationen. Aufgrund ihrer farbcodierten Dokumentation werden sie umgangssprachlich farblich bezeichnet.

Es gibt drei Tag-Sets:

Journal - Archivierung und Interchange ( Grün )
"Das freizügigste der Tag-Sets", in erster Linie für die Erfassung und Archivierung vorhandener Journaldaten gedacht.
Journal Publishing ( Blau )
"Ein mäßig präskriptives Tag-Set", das für den allgemeinen Gebrauch bei der Produktion und Veröffentlichung von Zeitschriften vorgesehen ist.
Formal ist dieses Modell eine Teilmenge des Archivierungsmodells . Dies ist die am häufigsten verwendete JATS-Variante.
Artikel Authoring ( orange )
"Das präskriptivste [engste und kleinste] der Tag-Sets", das für die relativ leichte Erstellung von Zeitschriftenartikeln gedacht ist, die für JATS gültig sind.
Formal ist dieses Modell eine Teilmenge des Publishing- Modells.

Dokumenttypdefinitionen (auch in Form von RELAX NG und XML-Schema veröffentlicht ) definieren jeden Satz und integrieren andere Standards wie MathML und XHTML-Tabellen (wenn auch nicht im XHTML- Namensraum ).

Dokumentenstruktur

JATS Publishing Set definiert ein Dokument, das eine Top-Level-Komponente einer Zeitschrift ist, wie beispielsweise ein Artikel, eine Buch- oder Produktrezension oder ein Leserbrief. Jedes dieser Dokumente besteht aus Titelseiten (erforderlich) und bis zu drei optionalen Teilen. Diese müssen in der folgenden Reihenfolge erscheinen:

Vordersache
Die Titelseite des Artikels enthält die Metadaten für den Artikel (auch Header-Informationen genannt), zum Beispiel den Titel des Artikels, die Zeitschrift, in der er erscheint, das Datum und die Ausgabe der Veröffentlichung für diese Ausgabe dieser Zeitschrift, eine Copyright-Erklärung usw Es können sowohl Metadaten auf Artikelebene als auch auf Ausgabeebene (im Element <article-meta>) und auf Zeitschriftenebene (im Element <journal-meta>) erfasst werden.
Hauptteil (des Artikels)
Der Hauptteil des Artikels ist der hauptsächliche textliche und grafische Inhalt des Artikels. Dies besteht normalerweise aus Absätzen und Abschnitten, die selbst Abbildungen, Tabellen, Seitenleisten (eingerahmter Text) usw. enthalten können. Der Hauptteil des Artikels ist optional, um diejenigen Repositorys aufzunehmen, die nur die Kopfzeileninformationen des Artikels enthalten und den Textinhalt nicht mit Tags versehen.
Rückenmaterie
Falls vorhanden, enthält die Artikelrückseite ergänzende Informationen zum Haupttext, z. B. ein Glossar, einen Anhang oder eine Liste zitierter Referenzen.
Schwimmendes Material
Ein Herausgeber kann sich dafür entscheiden, alle schwebenden Objekte in einem Artikel und dessen Hintergrund (wie Tabellen, Abbildungen, Textrandleisten usw.) in einem separaten Containerelement außerhalb des Erzählflusses zu platzieren, um die Verarbeitung zu erleichtern.

Nach dem Vorder-, Haupt-, Rücken- und Schwimmmaterial kann es entweder eine oder mehrere Antworten auf den Artikel geben oder einen oder mehrere untergeordnete Artikel.

Beispiel

Dies ist die Struktur des minimalen Artikels,

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article
  PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.0 20120330//EN"
         "JATS-journalpublishing1.dtd"
>
<article dtd-version="1.0" article-type="article" specific-use="migrated"
 xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" 
>
  <front>...</front>
  <body>...</body>
  <back>...</back>
</article>

Der DOCTYPEHeader ist optional, ein Erbe von SGML- und DTD- orientierten Validatoren . Das dtd-versionAttribut kann auch ohne DTD-Header verwendet werden.

Das Root-Element articleist für jede Version von JATS oder "JATS-Familie" als NLM-DTDs üblich. Die Regeln für das front, bodyund backTags Validierung, hängt von der jats Version, aber alle Versionen haben ähnliche Struktur, mit guter Verträglichkeit in einer Reihe von Jahren. Die Entwicklung des Schemas bewahrt eine Gesamtstabilität.

Seltener werden "nur front", "nur" frontund back"Variationen" auch für andere Zwecke als die Darstellung des vollständigen Inhalts verwendet. Die allgemeine Artikelzusammensetzung (als DTD-inhaltlicher Ausdruck ) ist

   (front, body?, back?, floats-group?, (sub-article* | response*))

Werkzeuge

Es gibt eine Vielzahl von Werkzeugen zum Erstellen, Bearbeiten, Konvertieren und Transformieren von JATS. Sie reichen von einfachen Formularen bis hin zur kompletten Konvertierungsautomatisierung:

Umstellung auf JATS

Nehmen Sie als Eingabe ein wissenschaftliches Dokument und erstellen Sie mit etwas menschlicher Unterstützung eine JATS-Ausgabe.

  • OpenOffice ( LibreOffice ) und MS Word- Dokumente zu JATS:
    • Typeset: stellt einen automatisierten Satz von Konvertern für MS-Word in JATS XML bereit .
    • OxGarage : kann Dokumente aus verschiedenen Formaten in "National Library of Medicine (NLM) DTD 3.0" konvertieren.
    • meTypeset : meTypeset "ist ein Fork des OxGarage-Stacks" "um vom Microsoft Word .docx-Format in NLM/JATS-XML zu konvertieren".
    • eXtyles : automatisiert zeitaufwendige Aspekte der Dokumentbearbeitung in Microsoft Word und exportiert nach JATS XML (sowie viele andere DTDs).
  • Markdown zu JATS: Pandoc 2.0 kann eine Reihe von Eingabeformaten in JATS konvertieren.
  • PDF zu JATS: Dies ist ein sehr schwierig zu lösendes Problem. Der Erfolg hängt davon ab, wie gut Ihre PDFs strukturiert sind und bei der Stapelkonvertierung, wie konsistent Ihre PDFs strukturiert sind.
    • Shabash Merops
    • PDF to JATS XML Converter von Typeset
    • Das Public Knowledge Project entwickelt eine Pipeline für die Konvertierung von PDF in JATS. Es beinhaltet die Verwendung von pdfx .
    • CERMIN-Inhaltsextraktor und MINEr

Umwandlung von JATS

Nehmen Sie JATS als Eingabe, erzeugen Sie eine andere Art von Dokument als Ausgabe.

  • von JATS zu HTML
    • JATS Preview Stylesheets (kanonische XSLT- Konvertierung), siehe klassischer (2013) Konverter.
    • eLife Lens konvertiert NLM-XML in JSON für die Anzeige mit HTML und Javascript.
  • von JATS zu PDF: einige JATS Preview Stylesheets, XSLT + XSL-FO Konvertierung.
  • von JATS zu EPUB.
  • Generisch (von JATS DTD): DtdAnalyzer — vergleicht JATS mit anderen DTDs und hilft bei der Erstellung einer XML-Darstellung, XSLT- und Schematron-Generierung und anderen Tools.

Herausgeber

  • Typeset bietet einen WYSIWYM- Editor für wissenschaftliche Artikel. Unterstützt XML-Exporte in den Standards NISO JATS und NLM JATS. Es wird hauptsächlich von Zeitschriften und Verlagen verwendet, die von Autoren eingereichte MS-Word-Dateien in XML, PDF, HTML und ePuB konvertieren möchten.
  • JATS Framework für oXygen XML Editor: Benutzer von oXygen XML Editor und oXygen XML Author können jetzt Unterstützung für aktuelle Versionen von NISO JATS (und als Bonus NLM BITS) installieren. Basierend auf einer in einer DOCTYPE-Deklaration angegebenen Kennung erkennt oXygen, dass Sie ein JATS-Dokument bearbeiten und stellt Stylesheets und Dienstprogramme bereit.
  • FontoXML for JATS: WYSIWYS-Editor zum Bearbeiten und Überprüfen von JATS-Inhalten:
  • PubRef "Pipeline": Browserbasierter JATS-Editor mit Echtzeit-Vorschau:
  • Annotum : ein WordPress-Theme, das WYSIWYG-Authoring in JATS (Kipling-Teilmenge), Peer-Review und redaktionelle Verwaltung sowie Veröffentlichung enthält.
  • JATS-Edition für den webbasierten XML-Editor Xeditor .
  • Textureditor des Substance Consortium. Der erste Online-Editor von "born to JATS".
  • Der von eLife entwickelte Libero Editor beschreibt sich selbst als "eine benutzerfreundliche Bearbeitungsoberfläche, die für Verlagsmitarbeiter und Autoren für die Produktion von hochwertigem JATS-XML entwickelt wurde".

Vorschau

Tools, die JATS als HTML rendern, normalerweise on-fly.

  • JATS-Vorschau-Stylesheets: Die JATS-Vorschau-Stylesheets sind eine Reihe von .xsl-, .xpl-, .css- und .sch-Dateien, die .html- oder .pdf-Versionen gültiger NISO Z39.96-2012 JATS 1.0-Dateien erstellen. Es ist in erster Linie für den internen Gebrauch durch Verlage und als Grundlage für die Anpassung gedacht.
  • Typeset - Ermöglicht das Generieren von HTML aus JATS XML mit einem Klick. Bietet auch die Möglichkeit, benutzerdefiniertes HTML basierend auf den Anforderungen des Journals zu generieren.
  • PubReader – "Die PubReader-Ansicht ist eine alternative Webpräsentation ... PubReader wurde speziell zur Verbesserung der Lesbarkeit auf Tablets und anderen Geräten mit kleinem Bildschirm entwickelt und kann auch auf Desktops und Laptops und von mehreren Webbrowsern verwendet werden".

Anpassung

  • Jatsdoc - Erzeugt Dokumentation für jede bestimmte JATS-Anpassung. Jatsdoc ist in den DtdAnalyzer von NCBI integriert .

Zentrale JATS-Repositorys

Als NISO JATS den De-facto- und De-jure- Standard für Open-Access-Zeitschriften einführte , hat die wissenschaftliche Gemeinschaft die JATS-Repositorien als eine Art Pflichtexemplar übernommen , die manchmal als wertvoller angesehen werden als die traditionellen digitalen Bibliotheken, in denen nur eine PDF-Version gespeichert ist. Offenes Wissen braucht reichhaltigere und strukturiertere Formate als JATS: PDF und JATS müssen als "gleicher Inhalt" zertifiziert sein und die Menge "PDF+JATS" bilden die Einheit der Pflichtexemplare. Liste der JATS-Repositorys und der darin enthaltenen:

Diese Repositorys überschneiden sich und derselbe Artikel kann von mehr als einem Repository gehalten werden.

Alternativen und Semantik

Es gibt einige Bemühungen und Experimente mit der RDF- Konvertierung im Jahr 2012, ohne Auswirkungen auf die JATS-Community.

Später, im Jahr 2016, wurde für den Semantic-Web- Kontext mit der SchemaOrg- Initiative die Klasse ScholarlyArticle definiert, die besser angenommen wurde. Es handelt sich um eine erste "JATS-ähnliche Standardisierung" für RDF-Nutzungskontexte.

Siehe auch

Verwendet von (digitale Langzeitarchivierung)

Verwendet von (Veröffentlichung)

Ähnlich zu

Verweise

Weiterlesen

Externe Links