lin-4 microRNA Vorläufer - lin-4 microRNA precursor

Lin-4-microRNA-Vorläufer
RF00052.jpg
Voraussichtliche Sekundärstruktur und Sequenzkonservierung von Lin-4
Kennungen
Symbol lin-4
Rfam RF00052
miRBase MI0000002
miRBase-Familie MIPF0000303
Andere Daten
RNA- Typ Gene ; miRNA
Domain (s) Eukaryota
GEHEN Der GO-Begriff muss mit GO beginnen: Der GO-Begriff muss mit GO beginnen:
DAMIT SO: 0001244
PDB- Strukturen PDBe

In der Molekularbiologie ist Lin-4 eine microRNA (miRNA), die aus einer Studie zum Entwicklungszeitpunkt beim Nematoden Caenorhabditis elegans identifiziert wurde . Es war das erste, das von den miRNAs entdeckt wurde, einer Klasse nichtkodierender RNAs, die an der Genregulation beteiligt sind. miRNAs werden als ~ 70 Nucleotidvorläufer transkribiert und anschließend vom Dicer- Enzym zu einem 21 Nucleotidprodukt verarbeitet. Das Ausmaß der Haarnadelvorläufer ist nicht allgemein bekannt und wird basierend auf der Haarnadelvorhersage geschätzt. Es wird angenommen, dass die Produkte durch vollständige oder teilweise Komplementarität mit mRNA regulatorische Rollen spielen. Es wurde gefunden, dass das lin-4- Gen innerhalb eines 4,11 kb-Introns eines separaten Wirtsgens liegt (siehe auch [1] ).

Transkription

Lin-4 wird von autonomen miRNA-Promotoren transkribiert und entwicklungsreguliert, wobei die Lin-4-miRNA-Akkumulation im L2-Stadium der postembryonalen Entwicklung auftritt. Zusätzlich dazu ist die Hochregulation von endogenen primären Lin-4-Transkripten beim Auftreten der reifen Lin-4-Form. Lin-4 befindet sich auf Chromosom II in C. elegans und ist komplementär zu Sequenzen in der 3'-untranslatierten Region (UTR) der Lin-14-mRNA. Dieses komplementäre Transkript enthält sieben Bindungsstellen zusammen mit dem 9-Nucleotid-Kernelement CUCAGGGAA. Es ist zu sehen, dass der Lin-4: Lin-14-Duplex eine ungewöhnliche Knickstruktur einnimmt, die durch induzierte Änderungen der Rillenabmessung und der Basenstapelung aufgrund der nicht übereinstimmenden Basenpaare verursacht wird. Dieses Lin-4: Lin-14-Paar wurde hinsichtlich seiner Modifikation der Entwicklung mit dem IGF-1- Weg in C. elegans verknüpft .

Entwicklungseinfluss

lin-4 bestimmt den Beginn der Larvenstadien von Entwicklungsereignissen bei C. elegans . Bei Mutationen mit Lin-4-Funktionsverlust (lf) kommt es zu einer Verzögerung der Entwicklungsschicksale von ihren anfänglich frühen bis zu ihren späteren Larvenstadien. Folgen sind heterochrone Entwicklungsmuster mit Verlust von Strukturen wie der Vulva und der adulten Nagelhaut. Lin-4 wirkt als negativer Regulator von Lin-14 und unterdrückt die Akkumulation des LIN-14-Proteins. Es zielt auch auf Lin-28 ab und reduziert seine Proteinexpression durch Translationshemmung. Die Basenpaarung zwischen Lin-4 und dem fraglichen Ziel ist diskontinuierlich und besteht aus zwei kurzen Helices.

Verweise

Externe Links