Nach dem Tod seines älteren Bruders Ptolemäus XIII von Ägypten am 13. Januar, 47 vor Christus und nach seinem Willen wurde er verkündet Pharao und Mitregent von ihrer älteren Schwester und restliche Pharao , Kleopatra VII von Ägypten . Er war etwa 12 Jahre alt, als er den Thron bestieg. Er und seine ältere Schwester Kleopatra waren verheiratet, aber Kleopatra war weiterhin Geliebte des römischen Diktators Julius Caesar . Es wird angenommen, dass Ptolemaios nur dem Namen nach geherrscht hat, als Zugeständnis an die ägyptische Tradition, wobei Kleopatra die eigentliche Autorität behielt.
Am 15. März 44 v. Chr. wurde Caesar in Rom von einer Gruppe von Verschwörern ermordet, deren bemerkenswerteste Mitglieder Marcus Junius Brutus und Gaius Cassius Longinus waren . Ptolemäus folgte ihm bald im Tod. Eine Inschrift, die ihn als lebendig erwähnt, wurde auf den 26. Juli 44 v. Chr. datiert. Es wird angenommen, bleibt aber ungewiss, dass Kleopatra ihren Mitherrscher mit Aconit vergiftet hat, um ihn durch seinen Neffen Ptolemaios XV. Caesar zu ersetzen , ihren Sohn von Caesar, der am 2. September 44 v als Nachfolger seines Vaters.