Dehnungsfaktor - Elongation factor

Ternärer Komplex aus EF-Tu (blau), tRNA (rot) und GTP (gelb). Aus PDB Molekül des Monats Elongationsfaktoren , September 2006.

Elongationsfaktoren sind eine Reihe von Proteinen, die während der Proteinsynthese am Ribosom wirken , um die translationale Elongation von der Bildung der ersten bis zur letzten Peptidbindung eines wachsenden Polypeptids zu erleichtern . Die häufigsten Elongationsfaktoren bei Prokaryoten sind EF-Tu , EF-Ts , EF-G . Bakterien und Eukaryoten verwenden zueinander weitgehend homologe Elongationsfaktoren, jedoch mit unterschiedlichen Strukturen und unterschiedlichen Forschungsnomenklaturen.

Die Elongation ist der schnellste Schritt bei der Translation. In Bakterien erfolgt dies mit einer Geschwindigkeit von 15 bis 20 hinzugefügten Aminosäuren pro Sekunde (etwa 45-60 Nukleotide pro Sekunde). Bei Eukaryoten beträgt die Rate etwa zwei Aminosäuren pro Sekunde (etwa 6 Nukleotide pro Sekunde gelesen). Dehnungsfaktoren spielen eine Rolle bei der Orchestrierung der Ereignisse dieses Prozesses und bei der Sicherstellung der hochgenauen Translation bei diesen Geschwindigkeiten.

Nomenklatur homologer EFs

Dehnungsfaktoren
Bakterien Eukaryotisch/Archaeal Funktion
EF-Tu eEF-1A (α) vermittelt den Eintritt der Aminoacyl- tRNA in eine freie Stelle des Ribosoms .
EF-Ts eEF-1B ( β γ ) dient als Guanin- Nukleotid-Austauschfaktor für EF-Tu und katalysiert die Freisetzung von GDP aus EF-Tu.
EF-G eEF-2 katalysiert die Translokation der tRNA und mRNA entlang des Ribosoms am Ende jeder Runde der Polypeptidverlängerung. Verursacht große Konformationsänderungen.
EF-P eIF-5A stimuliert möglicherweise die Bildung von Peptidbindungen und löst Blockaden.
EF-4 (Keiner) Korrekturlesen
Beachten Sie, dass EIF5A, das archaeale und eukaryontische Homolog zu EF-P, als Initiationsfaktor genannt wurde, jetzt aber auch als Elongationsfaktor betrachtet wird.

Zusätzlich zu ihrer zytoplasmatischen Maschinerie haben eukaryotische Mitochondrien und Plastiden ihre eigene Translationsmaschinerie, jede mit ihrem eigenen Satz von Elongationsfaktoren vom Bakterientyp. Beim Menschen umfassen sie TUFM , TSFM , GFM1 , GFM2 , GUF1 ; auch der nominale Releasefaktor MTRFR kann bei der Dehnung eine Rolle spielen.

In Bakterien benötigt Selenocysteinyl-tRNA einen speziellen Elongationsfaktor SelB ( P14081 ) bezogen auf EF-Tu. Einige wenige Homologe werden auch in Archaeen gefunden, aber die Funktionen sind unbekannt.

Als Ziel

Elongationsfaktoren sind Angriffspunkte für die Toxine einiger Krankheitserreger. Zum Beispiel Corynebacterium diphtheriae erzeugt Diphtherietoxin , die Abspaltungen Proteinfunktion in dem Wirt durch Elongationsfaktor inaktivierende (EF-2). Dies führt zu der Pathologie und den Symptomen, die mit Diphtherie verbunden sind . Ebenso inaktiviert Pseudomonas aeruginosa Exotoxin A EF-2.

Verweise

Weiterlesen

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  • Berg, JM et al. (2002). Biochemie , 5. Aufl. New York: WH Freeman and Company. ISBN  0-7167-3051-0 .
  • Singh, BD (2002). Grundlagen der Genetik , Neu-Delhi, Indien: Kalyani Publishers. ISBN  81-7663-109-4 .

Externe Links