SECHS1 - SIX1

SIX1
Verfügbare Strukturen
PDB	Orthologsuche: PDBe RCSB
Liste der PDB-ID-Codes
	4EGC
Bezeichner
Aliase	SIX1 , BOS3, DFNA23, TIP39, SIX Homöobox 1
Externe IDs	OMIM : 601205 MGI : 102780 Homologene : 4360 Genecards : SIX1
Genort ( Mensch )
Chr.	Chromosom 14 (Mensch)
Ende	60.658.259 bp
RNA - Expressionsmuster
	Weitere Referenzausdrucksdaten
Gen-Ontologie
Molekulare Funktion	• DNA-Bindung ; • Sequenzspezifische DNA-Bindung ; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 Aktivität des DNA-bindenden Transkriptionsfaktors ; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO: 0001205 DNA-bindende Transkriptionsaktivatoraktivität, RNA-Polymerase II-spezifisch ; • Chromatinbindung ; • GO:0000980 RNA-Polymerase II cis-regulatorische Region sequenzspezifische DNA-Bindung ; • GO:0001948 Proteinbindung ; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 Aktivität des DNA-bindenden Transkriptionsfaktors, RNA-Polymerase II-spezifisch ; • Bindung des Transkriptionskoaktivators ; • GO:0000975 Bindung der cis-regulatorischen Region der Transkription;
Zelluläre Komponente	• Zytoplasma ; • Transkriptionsregulatorkomplex ; • Nukleolus ; • Nukleus;
Biologischer Prozess	• Musterspezifikationsprozess ; • negative Regulation des Neurons apoptotischen Prozess ; • Regulation der Neuronendifferenzierung ; • embryonalen Skelettsystem Morphogenese ; • Mesonephros Tubulusbildung ; • Neurogenese ; • Tierorganentwicklung ; • Ureterknospe Entwicklung ; • Myoblasten Migration ; • positive Regulierung der in ureteric beteiligten Verzweigungs bud Morphogenese ; • renal Systementwicklung ; • Regulation der Transkription, DNA-gestützte ; • Epithelzelldifferenzierung ; • Bildung von Riechplakoden ; • Regulation der Skelettmuskelzelldifferenzierung ; • Zungenentwicklung ; • Organinduktion ; • Nierenentwicklung ; • Entwicklung anatomischer Struktur ; • Thymusentwicklung ; • Ureter-Glattmuskelzelldifferenzierung ; • Neuronenschicksal Spezifikation ; • Myotomentwicklung ; • Skelettsystem-Morphogenese ; • Ausflusstrakt-Morphogenese ; • Trigeminusganglionentwicklung ; • negative Regulation des apoptotischen Prozesses ; • negative Regulation der Transkription durch RNA-Polymerase II ; • sensorische Wahrnehmung von Geräuschen ; • Aorta morpho Genese ; • Regulierung der Verzweigung, die an der Verzweigung der Ureterknospen beteiligt ist ; • Morphogenese der pilzartigen Papille ; • Transkription, DNA-gestützte ; • Bildung von Neuronen ; • Entwicklung von Ohrenbläschen ; • Regulierung der Proteinlokalisation ; • Positive Regulation der Transkription, DNA-gestützte ; • Entwicklung multizellulärer Organismen ; • Verzweigung beteiligt bei der Ureterknospenmorphogenese ; • Schilddrüsenentwicklung ; • Innenohrmorphogenese ; • Cochlea-Morphogenese ; • Positive Regulation der Ureterknospenbildung ; • Positive Regulation der mesenchymalen Zellproliferation, die an der Ureterentwicklung beteiligt ist ; • Mittelohrmorphogenese ; • Regulation der synaptischen Anordnung an der neuromuskulären Verbindungsstelle ; • Proteinlokalisation zum Kern ; • Regulation der Genexpression ; • Morphogenese des embryonalen Schädelskeletts ; • Entwicklung des Innenohrs ; • Positive Regulation der Proliferation des sekundären Herzfeldes von Kardioblasten ; • Negative Regulation der Verzweigung, die an der Morphogenese der Ureterknospen beteiligt ist ; • Zellpopulation ; • Regulation von Epithelzellproliferation ; • Regulierung der Skelettmuskelsatellitenzellproliferation ; • Skelettmuskelgewebe Entwicklung ; • metanephrischen Mesenchym Entwicklung ; • Gesichtsnerv Morphogenese ; • positive Regulation der Transkription durch RNA - Polymerase II ; • pharyngealen Systementwicklung ; • apoptotischen Prozess ; • Transkription durch RNA - Polymerase II ; • zelluläre Antwort auf 3,3',5-Triiod-L-thyronin ; • negative Regulation der Transkription, DNA -gestützte ; • Regulation der Skelettmuskelzellproliferation ; • Skelettmuskelfaserentwicklung;
	Quellen: Amigo / QuickGO
Orthologe
	6495
	20471
	ENSG00000126778
	ENSMUSG00000051367
	Q15475
	Q62231
	NM_005982
	NM_009189
	NP_005973
	NP_033215
	Wikidata
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Das Homöobox-Protein SIX1 (Sineoculis homeobox homolog 1) ist ein Protein , das beim Menschen vom SIX1- Gen kodiert wird .

Funktion

Die SIX-Gene von Vertebraten sind Homologe des 'sine oculis' (so)-Gens von Drosophila, das hauptsächlich im sich entwickelnden visuellen System der Fliege exprimiert wird. Mitglieder der SIX-Genfamilie kodieren für Proteine, die durch eine divergente DNA-bindende Homöodomäne und eine vorgelagerte SIX-Domäne gekennzeichnet sind, die sowohl an der Bestimmung der DNA-Bindungsspezifität als auch an der Vermittlung von Protein-Protein-Wechselwirkungen beteiligt sein können. Es wurde gezeigt, dass Gene der SIX-Familie eine Rolle bei der Entwicklung von Wirbeltieren und Insekten spielen oder an der Aufrechterhaltung des differenzierten Zustands von Geweben beteiligt sind.[geliefert von OMIM]

Interaktionen

Es wurde gezeigt, dass SIX1 mit EYA1 , DACH, GRO und MDFI interagiert .

Verweise

Weiterlesen

Oliver G, Wehr R, Jenkins NA, Copeland NG, Cheyette BN, Hartenstein V, Zipursky SL, Gruss P (März 1995). „Homeobox-Gene und Bindegewebemusterung“. Entwicklung . 121 (3): 693–705. doi : 10.1242/dev.121.3.693 . PMID 7720577 .
Adrados I, Larrasa-Alonso J, Galarreta A, López-Antona I, Menéndez C, Abad M, Palmero I (2015). „Das Homöoprotein SIX1 kontrolliert die zelluläre Seneszenz durch die Regulation von p16INK4A und differenzierungsbezogenen Genen“ . Onkogen . 35 (27): 3485–3494. doi : 10.1038/onc.2015.408 . PMC 5730042 . PMID 26500063 .
Ford HL, Kabingu EN, Bump EA, Mutter GL, Pardee AB (Oktober 1998). „Aufhebung des G2-Zellzyklus-Checkpoints im Zusammenhang mit der Überexpression von HSIX1: ein möglicher Mechanismus der Brustkrebsentstehung“ . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 95 (21): 12608–13. Bibcode : 1998PNAS...9512608F . doi : 10.1073/pnas.95.21.12608 . PMC 22878 . PMID 9770533 .
Salam AA, Häfner FM, Linder TE, Spillmann T, Schinzel AA, Leal SM (Juni 2000). "Ein neuartiger Locus (DFNA23) für prälingualen autosomal-dominanten, nicht-syndromalen Hörverlust wird bei einer schweizerdeutschen Verwandtschaft auf 14q21-q22 abgebildet . " Amerikanische Zeitschrift für Humangenetik . 66 (6): 1984–8. doi : 10.1086/302931 . PMC 1378045 . PMID 10777717 .
Ford HL, Landesman-Bollag E, Dacwag CS, Stukenberg PT, Pardee AB, Seldin DC (Juli 2000). "Zellzyklus-regulierte Phosphorylierung des humanen SIX1-Homöodomäne-Proteins" . Die Zeitschrift für biologische Chemie . 275 (29): 22245–54. doi : 10.1074/jbc.M002446200 . PMID 10801845 .
Fan X, Brass LF, Poncz M, Spitz F, Maire P, Manning DR (Oktober 2000). "Die Alpha-Untereinheiten von Gz und Gi interagieren mit dem Auge ohne den Transkriptionskofaktor Eya2 und verhindern seine Interaktion mit den sechs Klassen von Homöodomänen-enthaltenden Proteinen" . Die Zeitschrift für biologische Chemie . 275 (41): 32129–34. doi : 10.1074/jbc.M004577200 . PMID 10906137 .
Buller C, Xu X, Marquis V, Schwanke R, Xu PX (November 2001). „Molekulare Wirkungen von Mutationen der Eya1-Domäne, die Organdefekte beim BOR-Syndrom verursachen“. Humane molekulare Genetik . 10 (24): 2775–81. doi : 10.1093/hmg/10.24.2775 . PMID 11734542 .
Li CM, Guo M, Borczuk A, Powell CA, Wei M, Thaker HM, Friedman R, Klein U, Tycko B (Juni 2002). "Genexpression im Wilms-Tumor ahmt das früheste festgelegte Stadium in der metanephrischen Mesenchym-Epithel-Übergang nach" . Das American Journal of Pathology . 160 (6): 2181–90. doi : 10.1016/S0002-9440(10)61166-2 . PMC 1850829 . PMID 12057921 .
Ikeda K, Watanabe Y, Ohto H, Kawakami K (Oktober 2002). "Molekulare Interaktion und synergistische Aktivierung eines Promotors durch Six-, Eya- und Dach-Proteine, die durch das CREB-Bindungsprotein vermittelt werden" . Molekular- und Zellbiologie . 22 (19): 6759–66. doi : 10.1128/MCB.22.19.6759-6766.2002 . PMC 134036 . PMID 12215533 .
López-Ríos J, Tessmar K, Loosli F, Wittbrodt J, Bovolenta P (Januar 2003). "Die Aktivität von Six3 und Six6 wird von Mitgliedern der Groucho-Familie moduliert" . Entwicklung . 130 (1): 185–95. doi : 10.1242/dev.00185 . PMID 12441302 .
Ruf RG, Berkman J, Wolf MT, Nürnberg P, Gattas M, Ruf EM, Hyland V, Kromberg J, Glass I, Macmillan J, Otto E, Nürnberg G, Lucke B, Hennies HC, Hildebrandt F (Juli 2003). "Ein Genort für das Branchio-otische Syndrom ist auf Chromosom 14q21.3-q24.3 abgebildet" . Zeitschrift für medizinische Genetik . 40 (7): 515–9. doi : 10.1136/jmg.40.7.515 . PMC 1735534 . PMID 12843324 .
Zheng W, Huang L, Wei ZB, Silvius D, Tang B, Xu PX (September 2003). "Die Rolle von Six1 in der Entwicklung des Gehörsystems von Säugetieren" . Entwicklung . 130 (17): 3989–4000. doi : 10.1242 / dev.00628 . PMC 3873880 . PMID 12874121 .
Li X, Oghi KA, Zhang J, Krones A, Bush KT, Glass CK, Nigam SK, Aggarwal AK, Maas R, Rose DW, Rosenfeld MG (November 2003). „Eya-Proteinphosphatase-Aktivität reguliert Six1-Dach-Eya-Transkriptionseffekte in der Säugetier-Organogenese“. Natur . 426 (6964): 247–54. Bibcode : 2003Natur.426..247L . doi : 10.1038/nature02083 . PMID 14628042 . S2CID 4348941 .
Coletta RD, Christensen K., Reichenberger KJ, Lamb J, Micomonaco D, Huang L, Wolf DM, Müller-Tidow C, Golub TR, Kawakami K, Ford HL (April 2004). „Das Six1-Homöoprotein stimuliert die Tumorentstehung durch Reaktivierung von Cyclin A1“ . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 101 (17): 6478–83. Bibcode : 2004PNAS..101.6478C . doi : 10.1073/pnas.0401139101 . PMC 404.070 . PMID 15123840 .
Grifone R, Laclef C, Spitz F, Lopez S, Demignon J, Guidotti JE, Kawakami K, Xu PX, Kelly R, Petrof BJ, Daegelen D, Concordet JP, Maire P (Juli 2004). „Die Expression von Six1 und Eya1 kann erwachsenen Muskel vom langsam zuckenden Phänotyp in den schnell zuckenden Phänotyp umprogrammieren“ . Molekular- und Zellbiologie . 24 (14): 6253–67. doi : 10.1128/MCB.24.14.6253-6267.2004 . PMC 434.262 . PMID 15226428 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (Oktober 2005). „Auf dem Weg zu einer Karte im Proteom-Maßstab des menschlichen Protein-Protein-Interaktionsnetzwerks“. Natur . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Ito T, Noguchi Y, Yashima T, Kitamura K (Mai 2006). „SIX1-Mutation im Zusammenhang mit einer Vergrößerung des vestibulären Aquädukts bei einem Patienten mit Branchio-Oto-Syndrom“. Das Laryngoskop . 116 (5): 796–9. doi : 10.1097/01.mlg.0000209096.40400.96 . PMID 16652090 . S2CID 19273457 .

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