Sp1-Transkriptionsfaktor - Sp1 transcription factor

SP1
Verfügbare Strukturen
PDB	Orthologsuche: PDBe RCSB
Liste der PDB-ID-Codes
	1SP1 , 1SP2 , 1VA1 , 1VA2 , 1VA3
Bezeichner
Aliase	SP1 , entrez:6667, Sp1-Transkriptionsfaktor
Externe IDs	OMIM : 189906 MGI : 98372 Homologen : 8276 GeneCards : SP1
Genort ( Mensch )
Chr.	Chromosom 12 (Mensch)
Ende	53.416.446 bp
Genortung ( Maus )
Chr.	Chromosom 15 (Maus)
Ende	102.436.404 bp
RNA - Expressionsmuster
	Weitere Referenzausdrucksdaten
Gen-Ontologie
Molekulare Funktion	• Proteinhomodimerisierungsaktivität ; • HMG-Box-Domänenbindung ; • Transkriptionsfaktorbindung ; • Histondeacetylasebindung ; • Metallionenbindung ; • Transkriptionsfaktoraktivität, RNA-Polymerase-II-Kernpromotor sequenzspezifische Bindung der proximalen Region ; • bHLH-Transkriptionsfaktorbindung ; • Protein-C-Terminusbindung ; • GO :0001948 Proteinbindung ; • Histon-Acetyltransferase-Bindung ; • Nukleinsäurebindung ; • Sequenzspezifische DNA-Bindung ; • RNA-Polymerase II-Transkriptionsregulationsregion Sequenzspezifische DNA-Bindung ; • DNA-Bindung ; • Doppelstrang-DNA-Bindung ; • GO:0001077, GO:0001212, GO: 0001213, GO:0001211, GO:0001205 Aktivität des DNA-bindenden Transkriptionsaktivators, RNA-Polymerase II-spezifisch ; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 Aktivität des DNA-bindenden Transkriptionsfaktors ; • GO:0000980 RNA-Polymerase II cis-regulatorische Region sequenzspezifische DNA-Bindung ; • Kernpromotorsequenz-spezifische DNA-Bindung ; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-bindende Transkriptionsfaktoraktivität, RNA po Lymerase II-spezifisch ; • GO:0001158 cis-regulatorische Region sequenzspezifische DNA-Bindung;
Zelluläre Komponente	• Zytoplasma ; • Nukleoplasma ; • Protein-DNA-Komplex ; • Kern ; • Transkriptionsrepressorkomplex;
Biologischer Prozess	• positive Regulation von Schwefelwasserstoff biosynthetischen Prozess ; • rhythmische Verfahren ; • Regulation der Transkription durch RNA - Polymerase II ; • positive Regulation der Transkription, DNA-Templat ; • GO: 0022415 viralen Prozess ; • Regulation der Transkription, DNA-Matrizen ; • Transkription, DNA-Templat ; • snRNA Transkription durch RNA-Polymerase II ; • zelluläre Reaktion auf Insulinstimulus ; • positive Regulation der Transkription durch RNA-Polymerase II ; • Regulation des Cholesterinbiosyntheseprozesses ; • positive Regulation der Genexpression ; • positive Regulation der Migration von Blutgefäßendothelzellen ; • positive Regulation der Angiogenese ; • positive Regulation von vaskuläre Endothelzellproliferation ; • Reaktion auf Hydroperoxid;
	Quellen: Amigo / QuickGO
Orthologe
	6667
	20683
	ENSG00000185591
	ENSMUSG000000001280
	P08047
	O89090
	NM_001251825 ; NM_003109 ; NM_138473
	NM_013672
	NP_001238754 ; NP_003100 ; NP_612482
	NP_038700
	Wikidata
Mensch anzeigen/bearbeiten	Maus anzeigen/bearbeiten

Der Transkriptionsfaktor Sp1 , auch als Spezifitätsprotein 1* bekannt, ist ein Protein , das beim Menschen vom SP1- Gen kodiert wird .

Funktion

Das von diesem Gen kodierte Protein ist ein Zinkfinger- Transkriptionsfaktor , der an GC-reiche Motive vieler Promotoren bindet. Das kodierte Protein ist an vielen zellulären Prozessen beteiligt, einschließlich Zelldifferenzierung, Zellwachstum, Apoptose , Immunreaktionen, Reaktion auf DNA-Schäden und Chromatin-Remodeling . Posttranslationale Modifikationen wie Phosphorylierung , Acetylierung , O- GlcNAcylierung und proteolytische Prozessierung beeinflussen signifikant die Aktivität dieses Proteins, das ein Aktivator oder ein Repressor sein kann.

Beim SV40- Virus bindet Sp1 an die GC-Boxen in der regulatorischen Region (RR) des Genoms.

Struktur

SP1 gehört zur Sp/KLF-Familie von Transkriptionsfaktoren. Das Protein ist 785 Aminosäuren lang und hat ein Molekulargewicht von 81 kDa. Der SP1-Transkriptionsfaktor enthält ein Zinkfinger-Proteinmotiv , über das er direkt an DNA bindet und die Gentranskription verstärkt. Seine Zinkfinger sind vom Cys ₂ /His ₂ -Typ und binden die Konsensussequenz 5'-(G/T)GGGCGG(G/A)(G/A)(C/T)-3' ( GC- Boxelement ). Im menschlichen Genom finden sich etwa 12.000 SP-1-Bindungsstellen.

Anwendungen

Sp1 wurde als Kontrollprotein zum Vergleich verwendet, wenn die Zunahme oder Abnahme des Arylkohlenwasserstoffrezeptors und/oder des Östrogenrezeptors untersucht wird , da es an beide bindet und im Allgemeinen auf einem relativ konstanten Niveau bleibt.

Kürzlich eine mutmaßliche Promotorregion in FTMT und positive Regulatoren {SP1, cAMP response element-binding protein (CREB) und Ying Yang 1 ( YY1 )] und negative Regulatoren [GATA2, Forkhead Box Protein A1 (FoxA1) und CCAAT Enhancer -bindendes Protein b (C/EBPb)] der FTMT-Transkription wurden identifiziert (Guaraldo et al, 2016). Die Wirkung von DFP auf die DNA-Bindungsaktivität dieser Regulatoren an den FTMT-Promotor wurde mit dem Chromatin-Immunopräzipitations-(ChIP)-Assay untersucht . Von den Regulatoren zeigte nur SP1 dosisabhängig eine signifikant erhöhte DNA-Bindungsaktivität nach DFP-Behandlung. Der SP1-Knockdown durch siRNA beseitigte den DFP-induzierten Anstieg der mRNA-Spiegel von FTMT, was auf eine SP1-vermittelte Regulation der FTMT-Expression in Gegenwart von DFP hinweist. Die Behandlung mit Deferipron erhöhte die Expression von zytoplasmatischem und nukleärem SP1 mit vorherrschender Lokalisation im Nukleus.

Inhibitoren

Plicamycin , ein antineoplastisches Antibiotikum, das von Streptomyces plicatus produziert wird , und Withaferin A , ein steroidales Lacton aus der Pflanze Withania somnifera , hemmen den Sp1-Transkriptionsfaktor.

miR-375-5p microRNA verringerte die Expression von SP1 und YAP1 in Darmkrebszellen signifikant . SP1- und YAP1- mRNAs sind direkte Ziele von miR-375-5p.

Interaktionen

Es wurde gezeigt, dass der Sp1-Transkriptionsfaktor interagiert mit:

AATF ,
CEBPB ,
COL1A1 ,
E2F1 ,
FOSL1 ,
GABPA ,
HDAC1 ,
HDAC2 ,
HMGA1 ,
HFCKW1 ,
HTT ,
KLF6 ,
MEF2C ,
MEF2D ,
MSX1 ,
Myogenin ,
POU2F1 ,
PPP1R13L ,
PSMC5 ,
PML ,
RELA ,
SMAD3 ,
SUMO1 ,
SF1 ,
TAL1 ,
UBC .
WRN ,
DDX3X

Verweise

Weiterlesen

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Externe Links

Sp1+Transkription+Faktor bei der US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
FactorBook SP1

Dieser Artikel enthält Texte der National Library of Medicine der Vereinigten Staaten , die gemeinfrei sind .

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